随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，午夜巨大显示屏中播放出影像，午夜连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
回复 :“闇之书事件”（参照魔法少女奈叶A's）的10年后。踏入19歳的高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风三人，怀抱着彼此的友情牵绊、为了追求各自的梦想实现而加入时空管理局，并以一流魔导师的身分活跃。在此当中，出现了新发现的太古遗产“圣遗晶石”（レリック），以及以此为目标而出现的谜样机械兵器“共鸣拓发者”（ガジェットドローン）。为了迅速对应日后被称为“圣遗晶石事件”的状况，八神疾风考虑到设置能够迅速对应的独立部队的必要性，设立了专责处理与太古遗产关连任务的特殊部队——“机动六课”。另一边，时间回溯到四年前。昴·中岛在遭到机场火灾卷入而几乎丧命之际，由于奈叶的出现而得救。因为憧憬著如同“自己理想中的形象”一般的奈叶，昴在当晚的满天星空之下，做出了“成为管理局的魔导师”的决定。四年后，经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴，与训练校时代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导师的升格试验。于远处凝视著两人考试的，分别是认定两人将成为“机动六课”的明日之星而投以注意的疾风与菲特、还有奈叶。在三人的注视之中，随着宣告试验开始的ReinForce II（统御之力zwei）的声音，拉开了“StrikerS”故事的序幕。
回复 :传奇故事还在继续！卡勒姆和瑞拉总算来到了魔法之地沙迪亚，开始归还龙王子阿兹回归他母亲——龙之女王的最危险的一段旅途。艾斯兰回到科塔利斯王国并登上王位，却不得不立刻面对与沙迪亚开战的压力。同时，被囚禁的艾伦在绝望中开始逐渐意识到他的新盟友：神秘的摘星精灵阿拉沃斯的真正力量。
黎明
回复 :九州大陆，仙道昌盛，世人皆以拜入仙门为荣。然而界壁裂缝突现，有异界魔族开始偷偷潜入九州仙门。异界魔族潜入各大仙门后，试图逐渐执掌仙门权柄，企图颠覆九州大陆。剑仙牧勋携同道好友阻拦魔族入侵，却不幸中了魔族陷阱，被误以为是仙门叛徒。牧勋为寻找时机，找寻魔族潜伏的线索，决定隐其踪迹不再示人，并将其独子东方灏交由妻子之氏族抚养照顾。身负帝族血脉却灵根不显的东方灏，一直被同族视作庸人，备受欺凌；本是剑仙之后，却因其父被魔族陷害而命途坎坷的他，在危机时刻，毅然凭借不懈努力化险为夷，一步步走向证道成仙之路。太初秘境，昭武王都，东方灏义气挺身，多次救友人于危难之中。同时，东方灏也从未忘记去寻找失踪的父亲。驯蛟龙，争仙魄，修为不断提升的他立志找回父亲，并重新凝聚各大仙门，将魔族赶出九州大陆。
