剧情简介
看破虚假，卡利击退伪装，卡利终至神之奇迹。这就是我们奇迹调查官的义务——天才科学家平贺，与古文书暗号解读专家罗伯特。两人是一对好搭档，是梵蒂冈所属的“奇迹调查官”——那是对来自全世界的奇迹的真伪进行调查与判别的秘密调查官。在为调查而造访的地点遇到的不可思议事件——浮现的圣痕、流泪的玛利亚像。在判定奇迹的真伪过程中，突然发生的奇怪事件——天才神父组合的事件簿，开幕！
帕斯卡利之岛
看破虚假，卡利击退伪装，卡利终至神之奇迹。这就是我们奇迹调查官的义务——天才科学家平贺，与古文书暗号解读专家罗伯特。两人是一对好搭档，是梵蒂冈所属的“奇迹调查官”——那是对来自全世界的奇迹的真伪进行调查与判别的秘密调查官。在为调查而造访的地点遇到的不可思议事件——浮现的圣痕、流泪的玛利亚像。在判定奇迹的真伪过程中，突然发生的奇怪事件——天才神父组合的事件簿，开幕！
回复 :「扭来扭去」「八尺大人」「如月车站」……作为真实怪谈流传下来的危险存在出没的〈里世界〉。那里是与现实相邻、充满谜团的世界。 纸越空鱼通过废屋内的门发现了〈里世界〉，并在那里遇到了仁科鸟子。这一邂逅，改变了空鱼的人生。鸟子拜托空鱼协助自己探索〈里世界〉，她正在寻找在〈里世界〉下落不明、名叫「冴月」的女性。为了探险、研究以及赚钱，空鱼开始和鸟子一起行动。踏入非日常当中的两人遭遇种种怪异，危险的求生开始了。
回复 :在该剧中，居然还有一个专门负责人力资源的常规角色（Amber Nash配音）。这在同类动画中非常少见。
李志清
回复 :自西元20XX年，人类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后，便开始对它进行研究，后来有人重建出来所谓的“神之语言”，并建立电脑程式以启动原始索哈尔，进行和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波动存在)连结的连结实验，但很不幸地，从上位领域流入下位领域的能量造成了事象变移，使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎完从从宇宙中“消失”，人类因而被迫逃亡，离开地球。到了四千年多后，在故事开始前十五的T.C.4753年，米尔奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件，在此次事件当中，米尔奇亚行星的人类疑似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击，并在冲突事件后消失，但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。在事件后，启动原始索哈尔（后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体，因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔）所需的神之语言、原始索哈尔的研究成果、米尔奇亚的U.M.N.座标等事物，都被封存在Y资料当中，而Y资料又被封存在百式观测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意识内，然而这么做却引起了各方势力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政府(游戏中统治各行星的政府，英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的生化人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。另一方面，在米尔奇亚冲突事件结束后的十几年，也就是大约在游戏EPI开始的时候，当时最大的企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵扰的名义，进行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的开发计划，但和当时多使用合成人(Relian)与生化人(Cyborg)的情况所不同的是，KOS-MOS是个纯粹的机械制品。另一方面，在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公司第一开发局研究人员卯月紫苑，正乘着当时载有还没正式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅途。但没想到其太空船却被冲著索哈尔而来的格诺西斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启动，卯月紫苑因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈尔有关的阴谋，以及会改变人类命运的事件当中……
