电视动画《进击！系统巨人中学校》改编自谏山创原作、系统中川沙树负责作画的《进击的巨人》的同名衍生漫画。今天开始就是中学一年级了。将学校中，不对，是世界中的巨人驱逐出去。怀着这样的梦想与希望迎来开学典礼早晨的艾伦，立刻又睡过去了。被青梅竹马的三笠叫起来，在马上就要迟到时才飞奔出家门的艾伦在上学路上疾驰，途中遇到了萨莎、让、康尼等来自其他小学的人们。“这就是进击中学吗”艾伦等人仰望的是高耸入云的巨大墙壁和校门。进入这里的话，开学典礼就近在眼前了。但艾伦并不知道，这所学校有着人类决不能违逆巨人的校规？！？