在一列从东京开往大阪的特快列车上，包青坐着一位尊贵而特殊的客人。她是来自欧洲英格拉姆帝国女王莎莉贝丝，包青随行的还有其年幼的儿子菲利浦王子。女王拥有一颗欧洲最大的宝石——水晶之母，这也引起了怪盗基德的注意。为了防止基德得手，女王身边布置大批保镖和警力。中森警官是日本警方的总代表，而他的女儿青子以及基德的真身快斗也同在这列火车之上。眼看离预定时间越来越近，快斗却始终没有找到宝石真正的藏匿地点。与此同时，国际宝石大盗杰卡尔和罗丝也尾随前来，他们企图在基德得手之际趁火打劫。同在火车上的柯南从伪装成乘务员的罗丝身上看出蹊跷。一场宝石的攻防战随即展开……
回复 :故事发生在戛玛戛玛水族馆之中，高中生海咲野心（伊藤美来 配音）是水族馆的代理馆长，对于经营水族馆，她充满了热情，也非常喜欢水族馆里的动物们，然而，因为经营不善，水族馆随时面临着倒闭的命运。宫泽风花（逢田梨香子 配音）曾经以成为偶像作为自己的理想，然而，在经历了一系列的挫折之后，她选择放弃了理想，并且只身一人来到了冲绳，想要在这里疗伤。在冲绳，风花邂逅了海咲野心，两个女孩之间产生了真挚的友谊。在城市观光协会工作的久高夏凜（Lynn 配音）、经常会去水族馆帮忙的仲村櫂（土屋神葉 配音）、水族馆的饲养员屋嘉间志空也（阿座上洋平 配音），很快，风花就结识了这些好友们。
回复 :劳瑞为街头流浪的虎斑猫莫里斯配音，莫里斯与一群会说话的老鼠和一个会吹笛子的男孩交为朋友。他们有一个完美的赚钱计划，让老鼠假装在小镇出没，然后让男孩驱散这些老鼠离开，获得报酬。但当他们尝试在Bad Blintz镇进行骗局时，事情并没有计划好。
回复 :野矢一树是转入公立海老栖川高校的新生，对天文感兴趣的他本想申请加入天文部，但却错入部室，成为了原本仅由女生组成的天闷部的一员。在这里，一树遇到了个性鲜明的女生部员们，有常常搞出问题来的户田山响子、天闷部的唯一常识人广松理圭、腐女子金森羽片以及副部长大庭莲实。就这样，野矢一树便与这些个性鲜明的天闷部女生部员们展开了一段轻松搞笑的校园生活……
